Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp558E9Q1J0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms