Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms