Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms