Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms