Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms