Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms