Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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