Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms