Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms