Protein–RNA interactions for Protein: B9EJV3

Greb1l, GREB1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1lB9EJV3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1lB9EJV3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms