Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms