Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71aB7XG49 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71aB7XG49 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms