Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm6133B2RY53 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm6133B2RY53 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm6133B2RY53 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm6133B2RY53 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm6133B2RY53 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6133B2RY53 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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