Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnldc1B2RXZ1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms