Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms