Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms