Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clrn2B2RVW2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms