Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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