Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uhrf1bp1B2KF50 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms