Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms