Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1V5

Vwa5b1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b1A9Z1V5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa5b1A9Z1V5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms