Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms