Protein–RNA interactions for Protein: A6H666

Cox8c, Cytochrome c oxidase subunit 8C, mitochondrial, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8cA6H666 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cox8cA6H666 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms