Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms