Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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