Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd1A2AKB4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd1A2AKB4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd1A2AKB4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Frmpd1A2AKB4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Frmpd1A2AKB4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Frmpd1A2AKB4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Frmpd1A2AKB4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd1A2AKB4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms