Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdfS4R2K0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms