Protein–RNA interactions for Protein: S4R1M3

H2afb2, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb2S4R1M3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.05■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
H2afb2S4R1M3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2afb2S4R1M3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms