Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms