Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcniQ9Z2V9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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