Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vamp5Q9Z2P8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms