Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Crlf3Q9Z2L7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Crlf3Q9Z2L7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Crlf3Q9Z2L7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Crlf3Q9Z2L7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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