Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd1Q9Z2E2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms