Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms