Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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