Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgr5Q9Z1P4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms