Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms