Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms