Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ror1Q9Z139 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms