Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NgfrQ9Z0W1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms