Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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