Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec2Q9WV35 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms