Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV03

Fam50a, Protein FAM50A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50aQ9WV03 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam50aQ9WV03 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam50aQ9WV03 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam50aQ9WV03 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam50aQ9WV03 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms