Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trim10Q9WUH5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trim10Q9WUH5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trim10Q9WUH5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trim10Q9WUH5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trim10Q9WUH5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trim10Q9WUH5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Trim10Q9WUH5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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