Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13bQ9WU72 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms