Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp18Q9WTV6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp18Q9WTV6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp18Q9WTV6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp18Q9WTV6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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