Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn8aQ9WTU3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms