Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L9

Cd164, Sialomucin core protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd164Q9R0L9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cd164Q9R0L9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms