Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms