Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wdr54Q9R0D8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms